电子商务运作系统中，保证相关主体身份真实性和交易安全性的机构是( )。

解析：电子商务系统是由消费者、企业、银行、物流配送体系和CA认证中心等组成。其中，CA认证中心是在虚拟互联网空间进行商务交易时，为保证相关主体身份的真实性和交易的安全性，所需要的一个具有权威性和公正性的第三方信任机构，即CA认证中心。