根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》,对民办非企业单位的违规行为，登记管理机关可以做出的行政处罚包括（）。

[解析]《民办非企业单位登记管理暂行条例》第二十五条规定，民办非企业单位有违规情形的，由登记管理机关予以警告，责令改正，可以限期停止活动：情节严重的，予以撤销登记；构成犯罪的，依法追究刑事责任。前款规定的行为有违法经营额或者违法所得的，予以没收，可以并处违法经营额1倍以上3倍以下或者违法所得3倍以上5倍以下的罚款。A、B、D、E正确。