补充医疗保险在计算应纳税所得额时的扣除税率为（ ）。

本题考查税前扣除的主要项目。企业根据国家有关政策规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除；超过的部分不予扣除。故此题正确答案为A。