劳动者违反竞业限制约定，向用人单位支付违约金后，用人单位（ ）。​

本题考查劳动者支付违约金后，其竞业限制义务的存续状态。

A选项错误，支付违约金并未免除其法定的竞业限制义务。

B选项正确，根据相关司法解释，支付违约金后，用人单位仍有权要求劳动者继续履行竞业限制义务。

C选项错误，协商变更非强制规定，但法律明确规定用人单位仍可要求继续履行。

D选项错误，用人单位无权仅因劳动者支付违约金而单方终止协议。

故选B。