该公司运用净现值法进行投资项目决策，其优点是（ ）。

净现值法的优点是：考虑了资金的时间价值（选项A），能反映各种投资方案的净收益（选项D）；其缺点是不能揭示各个投资方案本身可能达到的实际报酬率水平。

选项B错误：获利指数有利于对初始投资额不同的投资方案进行比较。

选项C错误：内含报酬率反映投资方案的真实报酬率。

故选AD选项。