下列情形中，免征耕地占用税的有（     ）。

本题考查耕地占用税的税收优惠。

选项A正确，军事设施占用耕地的，免征耕地占用税。

选项B正确，学校占用耕地用于教学设施建设的，免征耕地占用税。

选项C错误，农村居民仅在规定用地标准以内新建自住房可减半征收，超标准的不享受免税优惠。

选项D正确，医疗机构占用耕地用于医疗设施建设的，免征耕地占用税。

选项E错误，铁路线路占用耕地属于减征情形（减按2元/平方米），并非免征。

故选ABD。